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chipseq三种分析工具
2023-10-10 23:33  浏览:273  搜索引擎搜索“手机奥展网”
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masc2 DROMPAplus HOMER
使用体验:
1.HOMER最完整,不需要和其他工具配合就能完成callpeak和注释,注释文件也自带提供,支持自建。相比之下其他两者主要是提供callpeak,注释需要和其他工具配合,较为复杂。其中masc2功能最单一,向画图都需要用其他工具,DROMPAplus提供画图结果,但是提供的类型也较单一。
2.HOMER能找到最多的peak,masc2 和 DROMPAplus结果非常一致,但是他们找到的peak少于HOMER。
3.HOMER运行中给出的信息很全,方便观察。
总之,在不清楚三者原理的情况下HOMER的使用体验最好,工具完整且每一步的输出信息全面,其他两个参数都太少,信息给的也少。

发布人:7279****    IP:117.173.23.***     举报/删稿
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